●研究・実習棟
鉄筋二階建（総面積314㎡）、一階には実習室・暗実験室、調査機器倉庫があります。実習室は最大40名の実習が可能で、実体顕微鏡と生物顕微鏡をそれぞれ30台完備するとともに、海水の常時使用が可能です。二階には事務室、センター長室、会議室、研究室１、２、３の各部屋があります。
●研究・実習棟
鉄筋二階建（総面積314㎡）、一階には実習室・暗実験室, 調査機器倉庫があります. 実習室は最大40名の実習が可能で、実体顕微鏡と生物顕微鏡をそれぞれ30台完備するとともに、海水の常時使用が可能です. 二階には事務室、センター長室、会議室、研究室１、２、３の各部屋があります.
●実験棟
鉄筋平屋建（総面積252㎡）。第２実習室（セミナー室）。培養実験室、海水処理室、顕微鏡実験室、資材室、機器室などがあります。
実習室
第２実習室
海水処理室
●野外飼育水槽
4基の大型水槽がある。
●宿泊棟
鉄筋二階建（総面積356㎡）食堂、教員宿泊室（2室）、一般宿泊室（4室）ほかを備え、最大30名（児童の場合は、最大40名まで）の宿泊が可能です。
食堂
